Фармацевтичний факультет керує Університетською аптекою , яка є найбільшою державною аптекою в Словаччині, а також служить практичною навчальною базою для студентів, зокрема в рамках спеціалізованої освіти. Факультетська аптека, яка є некомерційною організацією, також розташована на території факультету.

Його престиж як європейського академічного закладу є значним. Він є частиною загальноуніверситетської мережі відмінних робочих місць для біомедичних досліджень, партнером понад трьох десятків іноземних науково-дослідних робочих місць з усього світу та членом EAFP (Європейської асоціації фармацевтичних факультетів) та FIP (Міжнародної фармацевтичної федерації). Програма Erasmus+ надає студентам можливість пройти одно- або двосеместрове навчання чи стажування в одному з 24 іноземних університетів або стажування в аптеках у рамках обов’язкової 5-місячної фармацевтичної практики на 5-му курсі.